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Ciencia e investigación agraria

On-line version ISSN 0718-1620

Abstract

CARRASCO, Basilio et al. Caracterización genética de cultivares de ciruelo japonés (Prunus salicina) mediante marcadores moleculares SSR y ISSR. Cienc. Inv. Agr. [online]. 2012, vol.39, n.3, pp.533-543. ISSN 0718-1620.  http://dx.doi.org/10.4067/S0718-16202012000300012.

La caracterización genética de 29 cultivares de ciruelo japonés (Prunus salicina) y cuatro cultivares de otras especies de Prunus, fue llevada a cabo mediante 97 alelos codominantes SSR y 232 loci binarios ISSR. Un elevado nivel de variabilidad genética fue encontrado en comparación a otras especies del género Prunus. En promedio para los loci SSR se obtuvo Na = 12,1, Ne = 5,2, Ho = 0,9, He = 0,8 y F= -0,127; y para los loci ISSR se obtuvo h = 0,15 e I = 0,27. Las relaciones genéticas entre cultivares fue estimada usando análisis de coordenadas principales (ACP) y análisis de cluster bayesiano (Structure). Este último permitió identificar dos subgrupos (k=2). El primer grupo incluyó a los cultivares de las cuatro especies de Prunus: P. salicina, P. armeniaca, P.domestica y P. ceracifera cuya membrecia varió entre 0,74 y 1,0. El segundo grupo incluyó a 19 cultivares de ciruelo japonés y un cultivar Plumcot con membrecias entre 0,57 y 0,99. Con algunas excepciones, el ACP mostró relaciones genéticas similares al análisis de cluster bayesiano. El nivel de diferenciación genética entre los dos grupos fue bajo (Gst =0,055 and Φst =0,04). Adicionalmente, se apreció un escaso desequilibrio de ligamiento (LD). Se sugiere que el alto nivel de variabilidad genética, el escaso nivel de LD y diferenciación entre grupos, puede ser explicado por los mecanismos de autoincompatibilidad que favorecen la hibridación entre cultivares genéticamente distantes, tanto a nivel intraespecífico como interespecífico. Estas estrategias son frecuentemente usadas en los programas de mejoramiento genético de ciruelo japonés.

Keywords : AMOVA; análisis Bayesiano; análisis de coordenadas principales (ACP); ciruelo; distancia genética; estructura.

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